第三季开场，天宫市出现了一个从未登记在数据库中的精灵“逆时者·凛绪”。她能短暂回溯时间，并警告五河士道：三个月后的“精灵峰会”上，他会因为做出一个选择而导致所有精灵暴走，造成全球毁灭。为了阻止未来，凛绪强行加入拉塔托斯克，不断用微小的回溯修正士道的日常选择。然而士道发现，无论怎么改变未来，那个导致毁灭的关键节点始终存在——他必须在所有精灵中选择一个作为唯一的“伴侣”，而其他精灵会因嫉妒而失控。士道拒绝选择，决定创造一个“全员存活的第三条路”，并为此与未来的自己展开了跨时空对决。
第三季成功摆脱了第二季的疲软，将“后宫”设定强行掰成了时间悖论的烧脑局。每一集都在推翻上一集的认知，对角色情感的挖掘也更深。战斗场面预算明显增加，结尾几集持续高能，老粉会哭得很惨。
六个临终病患决定组建一支摇滚乐队，他们的第一场也是最后一场演唱会，门票是“陪我说一个秘密”。
猫目在黑夜里给出的不是预言，而是反讽：真正的妖怪从不是妖灵，而是把信仰当商品的那群人。
罹患自闭症的天才男孩坚信自己是外星卫星，而脾气暴躁的退休宇航员是他回家的“陨石燃料”。
野蛮人柯南的儿子是个社恐，为了逃避继承战斧，他谎称自己是“和平主义者”跑去了大都会上班。
一个犹太老妇人的葬礼，召集了她遍布全球、互相仇恨的孩子们，必须在七天里完成“欢乐”的送别。
一只梦想成为王子的青蛙，在旅途中发现，真正的魔法是自己制造的。